小金瓦殿是全寺的一座大护法神殿，初建于明崇祯四年。一进两院，主殿为三层重檐铜瓦镏金建筑，殿顶中间有法轮，两边为祥麟的装饰物，金光闪闪，很是气派。

　　院内回廊墙壁上的壁画绚丽多彩，多是护法神像和佛教故事。二层回廊陈设野牛、羊、熊、猴等标本，有的有上百年了。据说，这些走兽标本象征一切妖魔鬼怪已被神征服。殿的左边有一匹白马标本，相传是三世达赖喇嘛从西藏拉萨到青海塔尔寺骑的。三世达赖喇嘛朝拜塔尔寺之后，要去蒙古传经说道，这匹白马怎么也不肯走，于是便留下来，不久，马不食而死。后人把它当神马，作为家神陈列供奉。时轮塔就矗立在小金瓦殿前。塔高13米，是1942年为纪念九世班禅为塔尔寺众僧讲授时轮大灌顶法而建造的。三层塔座支撑塔身，基座四周有四个塔龛，供有四大天王，第四层塔龛内还有金刚力士护法神像等。此塔造型别致，古雅秀丽。